Cours international : “Computational genomics”

 Cours theorique et pratique
06 - 09 avril 2010

Siege du Centre National pour la Recherche Scientifique et Technique – CNRST, Rabat, Maroc

 

Organisateurs :

  • Prof. Dr. ir. Jean Swings ( Universite de Gent , Belgique ), Jean.Swings@UGent.be.
   • Prof. Dr. Mohamed Saghi (Universite Mohammed V Agdal , Rabat , Maroc ), saghi@israbat.ac.ma.
  • Prof. Dr. Peter Dawyndt (Departement des Mathematiques et d'Informatique Appliquees, Universite de Gent , Belgique ), Peter.Dawyndt@UGent.be
   • Prof. Dr. El Houssine Bouyakhf (Faculte des Sciences, Universite Mohammed V - Agdal , Rabat , Maroc ), bouyakhf@fsr.ac.ma
   • Prof. Dr. Mohamed Benabdelkhalek: (Faculte des Sciences, Universite Mohammed V Agdal , Rabat , Maroc ), benabdel@fsr.ac.ma
   • Prof. Dr. Mohamed Amar (Laboratoire de Microbiologie et Biologie Moleculaire – LMBM,

Centre National pour la Recherche Scientifique et  Technique – CNRST, Rabat, Maroc ), amar@cnrst.ma

   • Prof. Dr David Ussery (Center for Biological Sequence Analysis, Department of Systems Biology, the Technical University of Denmark (DTU), Dave@CBS.dtu.dk

   • Dr.Karin Lagesen Assistant Professor, Center for Biological Sequence Analysis, Technical University of Denmark (DTU) &Researcher, Department of Informatics, University of Oslo, Norway,  karinl@cbs.dtu.dk

   • Dr. Klaas Vandepoele (Department of Plant Systems Biology, VIB/Ghent University, Belgique ), Klaas.Vandepoele@UGent.be

   • Dr. Elmostafa El fahime (chef de service des UATRS biologie, CNRST, Maroc) elfagime@cnrst.ma
   • Dr. Merrouch: (chef de Division, Moroccan Wide Area Network, MARWAN, CNRST Maroc), merrouch@marwan.ma

 

Frais d'inscription:
   • Cours Theorique : 800 DH / 75 EUROS
   • Cours Pratique et Theorique: 1700 DH / 155 EUROS
Les frais de sejour et de transport sont a la charge des participants.

Secretariat Mme.  Najat Bouachik et Mr. Noureddine Chajar   Laboratoire de Microbiologie et Biologie Moleculaire – LMBM, Centre National pour la Recherche Scientifique et Technique – CNRST
Angle avenue Allal El Fassi, avenue des FAR, Quartier Hay Ryad, BP. 8027 Nations Unies, 10102 Rabat, MAROC
Tel : +212 537 569 810 Fax: + 212 537 778 676 Tel: +212 537 778 676	Inscription: coursbioinformatique@gmail.com Personne contact: Prof. Mohamed Amar Email: amar@cnrst.ma

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

1. Sommaire

Le cours donnera un apercu general des connaissances recentes dans le domaine de l'analyse genomique et bioinformatique. Il mettra l'accent sur les techniques d'analyse genomique utilisant l'etat de l'art en bioinformatique. Les conferences rappelleront les nouvelles decouvertes scientifiques qui ont emerge durant les 5 dernieres annees concernant en particulier le sequencage des genomes procaryotes et eucaryotes et apporteront aussi les connaissances theoriques necessaires a toute analyse bioinformatique.

Les apres-midi seront consacrees aux travaux pratiques qui vont cibler quelques etudes de cas donnant une idee sur la bioinformatique telle qu’elle est pratiquee aujourd’hui. Ces seances pratiques sont reservees uniquement aux participants deja familiarises avec les commandes Unix/Linux et la programmation dans Matlab. Voir le programme du cours.

2. Langue du cours
Le cours sera donne en anglais.

3. Contenu du cours
• Conferences sur differents aspects d'analyse genomique et de bioinformatique.
• Sessions de discussions et debats.
• Sessions de formation pratique utilisant les notions de base de technologie d'information. (Voir le programme du cours)  

4. Programme du cours
Le cours se deroulera du 05 au 09 avril 2010 et comportera 34 h 30 mn reparties en:
  - conferences theoriques : les matins de 8h 30 a 13h 00
  - seances pratiques: les apres-midi de 14h 30 a 17h 30
Programme du cours international

5. Conferenciers
   • Prof. Dr. Peter Dawyndt (Department of Applied Mathematics and Computer Science, Ghent University , Belgique ), Peter.Dawyndt@UGent.be

   • Prof. Dr David Ussery (Prof. Dr David Ussery (Center for Biological Sequence Analysis, Department of Systems Biology, the Technical University of Denmark (DTU), Dave@CBS.dtu.dk

   • Dr.Karin Lagesen Assistant Professor, Center for Biological Sequence Analysis, Technical University of Denmark (DTU) &Researcher, Department of Informatics, University of Oslo, Norway,  karinl@cbs.dtu.dk

   • Dr. Klaas Vandepoele (Department of Plant Systems Biology, VIB/Ghent University, Belgique ), Klaas.Vandepoele@UGent.be  (Voir CVs des conferenciers)

   • Secretariat et assistance technique : Le personnel du LMBM et de MARWAN (CNRST- Maroc).

6. Criteres de selection et profil des participants
Ce cours est destine aussi bien aux enseignants chercheurs en biologie, aux informaticiens, aux ingenieurs agronomes, aux  medecins, aux pharmaciens qu'aux etudiants de troisieme cycle option biologie, informatique ou bioinformatique.

La selection sera basee sur les CV ; aussi les candidats sont-ils pries de donner un apercu sur leur theme de recherche et leur tache au sein de leur equipe ou laboratoire.

La priorite sera donnee a :
      • des candidats marocains travaillant dans des entreprises industrielles, des universites et des etablissements de formation et/ou recherche.
      • des participants originaires du Moyen Orient et/ou d'Afrique.

7. Nombre de participants :
    • Cours theorique: Maximum 100
       • Cours pratique: Maximum 40
    La connaissance de la langue anglaise est requise.

8. Materiels de cours
   •   Programme, manuel contenant l'information sur le contenu du cours
   •   Logiciels
   •   Equipements (Ordinateurs, Materiel informatique ...)
   •   Certificats

9. Resultats attendus
   •   Assurer le transfert de technologie dans le domaine d'analyse genomique et bioinformatique et formation d’etudiants de Master en bioinformatique.
  •   Constituer un reseau d'equipes de chercheurs en bioinformatique. Ce reseau serait constitue de chercheurs marocains interesses par le domaine de la bioinformatique, d'experts europeens et de chercheurs africains et du pourtour mediterraneen.

•    Formulaire d’inscription

la date limite d'inscription est le 26  mars 2010.